RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 IFNL1Q8IU54 200 aa34.07■■■■□ 3.04
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NOMO3-217ENST00000576589 MS4A4AQ96JQ5 239 aa34.07■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 CHGBP05060 677 aa34.06■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 GTF2A2P52657 109 aa34.06■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 PPATQ06203 517 aa34.06■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 PPIL2Q13356 520 aa34.06■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 SALL3Q9BXA9 1300 aa34.05■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 SCYL3Q8IZE3 742 aa34.05■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
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NOMO3-217ENST00000576589 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 IRF6O14896 467 aa34.04■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 HLA-DOAP06340 250 aa34.04■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 LCORLQ8N3X6 602 aa34.04■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 PICK1Q9NRD5 415 aa34.04■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 ALDH1A1P00352 501 aa34.03■■■■□ 3.04
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NOMO3-217ENST00000576589 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
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NOMO3-217ENST00000576589 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa34.02■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 MBD4O95243 580 aa34.02■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 SOX10P56693 466 aa34.02■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 CCL15Q16663 113 aa34.02■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa34.02■■■■□ 3.04
NOMO3-217ENST00000576589 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
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NOMO3-217ENST00000576589 TRIM34Q9BYJ4 488 aa34.01■■■■□ 3.03
NOMO3-217ENST00000576589 STAP2Q9UGK3 403 aa34.01■■■■□ 3.03
NOMO3-217ENST00000576589 GPR25O00155 361 aa34■■■■□ 3.03
NOMO3-217ENST00000576589 PDE1AP54750 535 aa34■■■■□ 3.03
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NOMO3-217ENST00000576589 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
NOMO3-217ENST00000576589 CETPP11597 493 aa33.99■■■■□ 3.03
NOMO3-217ENST00000576589 PTPRAP18433 802 aa33.99■■■■□ 3.03
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NOMO3-217ENST00000576589 SDR42E1Q8WUS8 393 aa33.99■■■■□ 3.03
NOMO3-217ENST00000576589 ZHX2Q9Y6X8 837 aa33.99■■■■□ 3.03
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NOMO3-217ENST00000576589 TTC6Q86TZ1 520 aa33.98■■■■□ 3.03
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NOMO3-217ENST00000576589 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
NOMO3-217ENST00000576589 CAP2P40123 477 aa33.97■■■■□ 3.03
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NOMO3-217ENST00000576589 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa33.87■■■■□ 3.01
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