RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.89■■□□□ 1.74
STX4-216ENST00000566353 FOCADQ5VW36 1801 aa25.89■■□□□ 1.74
STX4-216ENST00000566353 TREML2Q5T2D2 321 aa25.89■■□□□ 1.74
STX4-216ENST00000566353 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.89■■□□□ 1.74
STX4-216ENST00000566353 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
STX4-216ENST00000566353 H0YGN5 161 aa25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 FLT3LGP49771 235 aa25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 POLA2Q14181 598 aa25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 TNNI3KQ59H18 835 aa25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 GPR108Q9NPR9 543 aa25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 PNMA3Q9UL41 463 aa25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.88■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 ADCY3O60266 1144 aa25.87■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 SPP2Q13103 211 aa25.87■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.87■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.87■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 SNRKQ9NRH2 765 aa25.87■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 CAP2P40123 477 aa25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 ELNP15502 786 aa25.85■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 IRF5Q13568 498 aa25.85■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.85■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.85■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 SSH3Q8TE77 659 aa25.85■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.85■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 BAG3O95817 575 aa25.84■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 INHAP05111 366 aa25.84■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 HMGCS2P54868 508 aa25.84■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 USP17L5A8MUK1 530 aa25.83■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 ATP8B2P98198 1209 aa25.83■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 DPF3Q92784 378 aa25.83■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.83■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.83■■□□□ 1.73
STX4-216ENST00000566353 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 PLCG2P16885 1265 aa25.82■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.82■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 COA7Q96BR5 231 aa25.82■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.82■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.82■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 CEP290O15078 2479 aa25.82■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.81■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.81■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.81■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.81■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 FLT1P17948 1338 aa25.81■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 SGPL1O95470 568 aa25.8■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 PPP4CP60510 307 aa25.8■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.8■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 ZAP70P43403 619 aa25.79■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.79■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 DNAJC18Q9H819 358 aa25.79■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 WDR18Q9BV38 432 aa25.78■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 IGSF3O75054 1194 aa25.77■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 ASNSP08243 561 aa25.77■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 MTMR2Q13614 643 aa25.77■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.77■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 DEFB118Q96PH6 123 aa25.77■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.77■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
STX4-216ENST00000566353 JAG1P78504 1218 aa25.76■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 PALD1Q9ULE6 856 aa25.76■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 PLXNB2O15031 1838 aa25.76■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 MYH1P12882 1939 aa25.75■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 RLBP1P12271 317 aa25.75■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 CAPN2P17655 700 aa25.75■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 BACE1P56817 501 aa25.75■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.75■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms