RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 UBE3CQ15386 1083 aa23.07■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.07■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 TNS4Q8IZW8 715 aa23.07■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 DNAJC18Q9H819 358 aa23.07■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 ALDH1A1P00352 501 aa23.06■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.06■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.06■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 ARMT1Q9H993 441 aa23.06■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 ERC2O15083 957 aa23.05■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 MBD4O95243 580 aa23.05■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 PTPRAP18433 802 aa23.05■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 SNAPC2Q13487 334 aa23.05■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 PICK1Q9NRD5 415 aa23.05■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.05■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 CETPP11597 493 aa23.04■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.04■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.04■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.04■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.04■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 LNPKQ9C0E8 428 aa23.04■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.04■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 PRKAB2O43741 272 aa23.03■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 HLA-DOAP06340 250 aa23.03■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.03■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 STAP2Q9UGK3 403 aa23.03■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 AK9Q5TCS8 1911 aa23.03■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 GPR25O00155 361 aa23.02■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 CAP2P40123 477 aa23.02■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 MOGSQ13724 837 aa23.02■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
EDC3-211ENST00000566243 BTBD19C9JJ37 291 aa23.01■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 PLCD1P51178 756 aa23.01■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 PDE1AP54750 535 aa23.01■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 JAG1P78504 1218 aa23.01■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 EVX2Q03828 476 aa23.01■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 CRHR2Q13324 411 aa23.01■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.01■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 LAMB1P07942 1786 aa23.01■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 CXCL11O14625 94 aa23■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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EDC3-211ENST00000566243 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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EDC3-211ENST00000566243 SIPA1L1O43166 1804 aa23■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 TTC6Q86TZ1 520 aa22.99■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.99■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 OSBP2Q969R2 916 aa22.99■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.99■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 EHD4Q9H223 541 aa22.99■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.99■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 FOCADQ5VW36 1801 aa22.98■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.98■■□□□ 1.27
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EDC3-211ENST00000566243 APPBP2Q92624 585 aa22.98■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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EDC3-211ENST00000566243 GDF11O95390 407 aa22.97■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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EDC3-211ENST00000566243 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.97■■□□□ 1.27
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EDC3-211ENST00000566243 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.96■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.96■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.96■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 FSD1Q9BTV5 496 aa22.96■■□□□ 1.27
EDC3-211ENST00000566243 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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EDC3-211ENST00000566243 USP17L5A8MUK1 530 aa22.95■■□□□ 1.26
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EDC3-211ENST00000566243 FKTNO75072 461 aa22.95■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 SPP2Q13103 211 aa22.95■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.95■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.95■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.95■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.94■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 SMIM22K7EJ46 135 aa22.94■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 PDHXO00330 501 aa22.94■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 ASNSP08243 561 aa22.94■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 SHMT1P34896 483 aa22.94■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 DGKZQ13574 1117 aa22.94■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 IFFO2Q5TF58 517 aa22.94■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.94■■□□□ 1.26
EDC3-211ENST00000566243 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.94■■□□□ 1.26
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