RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SNRKQ9NRH2 765 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TEX11Q8IYF3 940 aa20.53■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCL5P13501 91 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ATP8B2P98198 1209 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FOCADQ5VW36 1801 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CAP2P40123 477 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GJA8P48165 433 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPP2Q13103 211 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RLBP1P12271 317 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FLT3LGP49771 235 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RNF208Q9H0X6 261 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GJB1P08034 283 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UBXN2AP68543 259 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FLT1P17948 1338 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 H0YGN5 161 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ADCY3O60266 1144 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BAG3O95817 575 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ELNP15502 786 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZAP70P43403 619 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HMGCS2P54868 508 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PPP4CP60510 307 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DNAJC18Q9H819 358 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PNMA3Q9UL41 463 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 USP17L5A8MUK1 530 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 JAG1P78504 1218 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IRF5Q13568 498 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 INHAP05111 366 aa20.46■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PLCG2P16885 1265 aa20.46■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.46■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.46■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SZT2Q5T011 3432 aa20.45■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MIER1Q8N108 512 aa20.45■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PALD1Q9ULE6 856 aa20.45■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MTMR2Q13614 643 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 COA7Q96BR5 231 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 WDR18Q9BV38 432 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGSF3O75054 1194 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SGPL1O95470 568 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.863e-6■■■□□ 15.2
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CEP85Q6P2H3 762 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DPF3Q92784 378 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ASNSP08243 561 aa20.42■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BACE1P56817 501 aa20.42■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.42■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms