RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	PDZD3	Q86UT5	571 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD4	Q8TB40	342 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXQ1	Q9C009	403 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	EHD4	Q9H223	541 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCB6	Q9NP58	842 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	ARID3C	A6NKF2	412 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	EOMES	O95936	686 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	RAC2	P15153	192 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	BMP7	P18075	431 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	FAAP100	Q0VG06	881 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	GGN	Q86UU5	652 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf38	Q8TB03	319 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	NFKB2	Q00653	900 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	MTMR3	Q13615	1198 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AKAP13-223	ENST00000560957	NTF4	P34130	210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		5.08	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		5.08	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	C14orf37	Q86TY3	774 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNB2	Q92953	911 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	NEFL	P07196	543 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC6	Q86TZ1	520 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD4A	Q8N468	514 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	NPHS2	Q9NP85	383 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM13	O60858	407 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA7A	O75326	666 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	HPX	P02790	462 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	ADRB1	P08588	477 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	DLG4	P78352	724 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	MYLIP	Q8WY64	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR33	A8MZF0	331 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BS24	57 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	SSFA2	P28290	1259 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	FANCG	O15287	622 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX10	O60683	326 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	RING1	Q06587	406 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF385B	Q569K4	471 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	PPM1J	Q5JR12	505 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	SULF2	Q8IWU5	870 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	KCT2	Q8NC54	265 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	PSPN	O60542	156 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	LRIG2	O94898	1065 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	CELA3B	P08861	270 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	ARNT	P27540	789 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVFC1	P60507	584 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	STK35	Q8TDR2	534 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
AKAP13-223	ENST00000560957	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61

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