RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 RAC2P15153 192 aa5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 SPATS1Q496A3 300 aa5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ERICH6BQ5W0A0 696 aa5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.91□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.9□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1W2PP55 124 aa5.9□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 SASH1O94885 1247 aa5.9□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ERVFC1P60507 584 aa5.9□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF385BQ569K4 471 aa5.9□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.9□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 KCTD3Q9Y597 815 aa5.9□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 TTC6Q86TZ1 520 aa5.89□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 SEMA7AO75326 666 aa5.88□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.88□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC82Q8N4S0 544 aa5.88□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 MYLIPQ8WY64 445 aa5.88□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.88□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.88□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 POLIQ9UNA4 740 aa5.88□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.88□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 EOMESO95936 686 aa5.87□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.87□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 FOXQ1Q9C009 403 aa5.87□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 GCM1Q9NP62 436 aa5.87□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 KRT82Q9NSB4 513 aa5.87□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 HPXP02790 462 aa5.86□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 ITPKAP23677 461 aa5.86□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 SSPNQ14714 243 aa5.86□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 RNF214Q8ND24 703 aa5.86□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 PRR33A8MZF0 331 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 RFXAPO00287 272 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 PEX10O60683 326 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 HELQQ8TDG4 1101 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 RNF32Q9H0A6 362 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 H3BS24 57 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 MPSTP25325 297 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 MTMR3Q13615 1198 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF605Q86T29 641 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 IRF2BP1Q8IU81 584 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 GALNT12Q8IXK2 581 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM227B-211ENST00000560557 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 CARNS1A5YM72 827 aa5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 SSFA2P28290 1259 aa5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 HK2P52789 917 aa5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 EHHADHQ08426 723 aa5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 TEPSINQ96N21 525 aa5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 SGPP1Q9BX95 441 aa5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.83□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 ERVK-24P63145 666 aa5.82□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.82□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.82□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 SP110Q9HB58 689 aa5.82□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.82□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 ZXDAP98168 799 aa5.81□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.81□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 PANK1Q8TE04 598 aa5.81□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 PI3P19957 117 aa5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 NTF4P34130 210 aa5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 PLP2Q04941 152 aa5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 FAAP100Q0VG06 881 aa5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 MFSD4AQ8N468 514 aa5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.8□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.79□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.79□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.79□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa5.79□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.79□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 PDZD3Q86UT5 571 aa5.79□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 GPR20Q99678 358 aa5.79□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms