RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDH1Q08174 1060 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 NFKBIBQ15653 356 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 VPS37DQ86XT2 251 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 FBLIM1Q8WUP2 373 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS6KC1Q96S38 1066 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 TCF12Q99081 682 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 GMLQ99445 158 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 IFT57Q9NWB7 429 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 SWAP70Q9UH65 585 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.57□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 H3BRB1 525 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CCER2I3L3R5 266 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 PLIN1O60240 522 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP11A1P05108 521 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ADH5P11766 374 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 FOSL1P15407 271 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 MAOBP27338 520 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF423Q2M1K9 1284 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 GLYCTKQ8IVS8 523 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 AMOTL1Q8IY63 956 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 EVI5LQ96CN4 794 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 FRMD6Q96NE9 622 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 FMNL2Q96PY5 1086 aa4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CLSPNQ9HAW4 1339 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 NDUFB5O43674 189 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CTSBP07858 339 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 POU4F3Q15319 338 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ECM1Q16610 540 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 MSMPQ1L6U9 139 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 USPL1Q5W0Q7 1092 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ZAR1Q86SH2 424 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 SHISA5Q8N114 240 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 RELTQ969Z4 430 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 TBC1D32Q96NH3 1257 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CEP89Q96ST8 783 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 B3GALT4O96024 378 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ADMP35318 185 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGAP4P98171 946 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 PDE3BQ13370 1112 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 MAP7Q14244 749 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 MYBPC2Q14324 1141 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 JDP2Q8WYK2 163 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CORO1BQ9BR76 489 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 EHD4Q9H223 541 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF576Q9H609 170 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 RAD18Q9NS91 495 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTL7BQ9Y614 415 aa4.54□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM170BA6NMN3 283 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ENPP3O14638 875 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP26A1O43174 497 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ECEL1O95672 775 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 PRNPP04156 253 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB6AP20340 208 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ITPKAP23677 461 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF76P36508 570 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ORC1Q13415 861 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF280DQ6N043 979 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 DYMQ7RTS9 669 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 ABI1Q8IZP0 508 aa4.53□□□□□ -1.68
SYF2P1-201ENST00000550658 GATA6Q92908 595 aa4.53□□□□□ -1.68
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