RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548896.1

HECTD4-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 4

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-208	ENST00000548896	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	STK32A	Q8WU08	396 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	NUDC	Q9Y266	331 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	LY75	O60449	1722 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	BHMT	Q93088	406 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	GSX2	Q9BZM3	304 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	FLT4	P35916	1363 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	KRBA1	A5PL33	1030 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	PRMT3	O60678	531 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	NEFM	P07197	916 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	HSPA6	P17066	643 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	EFCC1	Q9HA90	598 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	CCER2	I3L3R5	266 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	INPP5B	P32019	993 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	IDH3A	P50213	366 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	OCLN	Q16625	522 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	ADCY9	O60503	1353 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	ATP10D	Q9P241	1426 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	MICAL2	O94851	1124 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	PPP2R1A	P30153	589 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	ADH7	P40394	386 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	NBPF4	Q96M43	638 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	MTHFS	P49914	203 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	CCIN	Q13939	588 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	TRIM11	Q96F44	468 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HECTD4-208	ENST00000548896	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	EPB42	P16452	691 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	COX20	Q5RI15	118 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	IFT43	Q96FT9	208 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	MRS2	Q9HD23	443 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	POLK	Q9UBT6	870 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	MEGF6	O75095	1541 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	INSR	P06213	1382 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896		M0R082	166 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	MSTN	O14793	375 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	SSFA2	P28290	1259 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	ARSD	P51689	593 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	PALLD	Q8WX93	1383 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	OPLAH	O14841	1288 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	MAFG	O15525	162 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	ALB	P02768	609 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	IGFLR1	Q9H665	355 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	CYP27B1	O15528	508 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	NFKB1	P19838	968 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	TGFB2	P61812	414 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	KCNA1	Q09470	495 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	MSL1	Q68DK7	614 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	TOMM70	O94826	608 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	PROC	P04070	461 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	TREML1	Q86YW5	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	SPG7	Q9UQ90	795 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	C5	P01031	1676 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HECTD4-208	ENST00000548896	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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