RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-205ENST00000528462 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 LAMB1P07942 1786 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 HAND2P61296 217 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 RASEFQ8IZ41 740 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D12O60347 775 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 NT5C2P49902 561 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 EVX2Q03828 476 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 HOOK2Q96ED9 719 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 SMIM22K7EJ46 135 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT32Q14532 448 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 SWAP70Q9UH65 585 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 YY1P25490 414 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 PDE4BQ07343 736 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 SIPA1L1O43166 1804 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 E7EWF7 191 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 ORC4O43929 436 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 ADM5C9JUS6 153 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF3CO14782 793 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 USP48Q86UV5 1035 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJC18Q9H819 358 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-205ENST00000528462 CDK8P49336 464 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 CHADLQ6NUI6 762 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 TRDNQ13061 729 aa26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT23Q9C075 422 aa26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 SHMT1P34896 483 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 DCAF15Q66K64 600 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 CDCA5Q96FF9 252 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMA5P28066 241 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 NCOA7Q8NI08 942 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF2CQ99661 725 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 NEDD4P46934 1319 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC17Q96LX7 622 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 NEK1Q96PY6 1258 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 INCENPQ9NQS7 918 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 RASA1P20936 1047 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 ESR2Q92731 530 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 NF2P35240 595 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 IL27Q8NEV9 243 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-205ENST00000528462 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 PRDM1O75626 825 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 SLURP2P0DP57 97 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 DLK2Q6UY11 383 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM196BA6NMK8 535 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 B4E1Z4 1266 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF341Q9BYN7 854 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 TOMM70O94826 608 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 MTA3Q9BTC8 594 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 TOMM22Q9NS69 142 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.99■■□□□ 1.75
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