RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-205ENST00000520166 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-205ENST00000520166 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-205ENST00000520166 HACL1Q9UJ83 578 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-205ENST00000520166 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.828e-6■■■□□ 18.6
TSNARE1-205ENST00000520166 GLTPD2A6NH11 291 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 DTNBO60941 627 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 PSMA5P28066 241 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 NCOA7Q8NI08 942 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 SENP2Q9HC62 589 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 FGRP09769 529 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 LAMB1P07942 1786 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 Q6ZUG5 572 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 DNAJC18Q9H819 358 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 PRC1O43663 620 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 NMT2O60551 498 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 CDK8P49336 464 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 SIPA1L1O43166 1804 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 MYO1BO43795 1136 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 ENTPD3O75355 529 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 LARGE1O95461 756 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 GABPAQ06546 454 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 TRDNQ13061 729 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 RASA3Q14644 834 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM151AQ8WW52 585 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 SNX21Q969T3 373 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 RASA1P20936 1047 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 GGA3Q9NZ52 723 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 ST18O60284 1047 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 MCM5P33992 734 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 SHMT1P34896 483 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 TTC6Q86TZ1 520 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 BRF1Q92994 677 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 ORC4O43929 436 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 MMP14P50281 582 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 APOBRQ0VD83 1088 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 TEPSINQ96N21 525 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 CSRNP1Q96S65 589 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 KRT23Q9C075 422 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-205ENST00000520166 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 POTEIP0CG38 1075 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 POTEJP0CG39 1038 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 EPHX2P34913 555 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 JAG1P78504 1218 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 TFAP4Q01664 338 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 PDE4BQ07343 736 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 FZD1Q9UP38 647 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 HLA-DOAP06340 250 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 AKR1B1P15121 316 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 ME3Q16798 604 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM83AQ86UY5 434 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 HSCBQ8IWL3 235 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 NECAB1Q8N987 351 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 ESR2Q92731 530 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 TMX3Q96JJ7 454 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1-205ENST00000520166 ST3GAL1Q11201 340 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms