RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 BMP3P12645 472 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 SOX9P48436 509 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATE1O95260 518 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 IMPDH2P12268 514 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 MCM4P33991 863 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 NTF4P34130 210 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARID5AQ03989 594 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 MLECQ14165 292 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAP7Q14244 749 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 ITGB2P05107 769 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 NEFMP07197 916 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAB6AP20340 208 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 GRK4P32298 578 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 SGO2Q562F6 1265 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 ISL2Q96A47 359 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 TP53INP1Q96A56 240 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 GMLQ99445 158 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 GINM1Q9NU53 330 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 HTR3BO95264 441 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 PGRP06401 933 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLCG1P19174 1290 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 RXRBP28702 533 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 HID1Q8IV36 788 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 GRIN3BO60391 1043 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGHA1P01876 353 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 CAP2P40123 477 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 GK5Q6ZS86 529 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLCQ05315 142 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 PAOXQ6QHF9 649 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 BEND4Q6ZU67 534 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAXQ9Y2V3 346 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 MSTNO14793 375 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 NFICP08651 508 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC6A19Q695T7 634 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 GMIPQ9P107 970 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 PROCP04070 461 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 FGRP09769 529 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM87BQ96K49 555 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBRSQ9HAH7 460 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 STOML1Q9UBI4 398 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRIG2O94898 1065 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 CRBNQ96SW2 442 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 FOXQ1Q9C009 403 aa8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms