RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 NETO1Q8TDF5 533 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 CSADQ9Y600 493 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 INPP5AQ14642 412 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 MISP3Q96FF7 219 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 HMGXB3Q12766 1538 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 ITGB5P18084 799 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 BNIP3Q12983 259 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 VAV3Q9UKW4 847 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 FGD1P98174 961 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 BTBD11A6QL63 1104 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 EOMESO95936 686 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 CEACAM5P06731 702 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 CAP2P40123 477 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 PRKCQQ04759 706 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 CD8BP10966 210 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 CDK8P49336 464 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 KCT2Q8NC54 265 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 ASIC4Q96FT7 647 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 GFRA2O00451 464 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 FUT4P22083 530 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 DAB2P98082 770 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 PLCL1Q15111 1095 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 FBRSQ9HAH7 460 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 LRIG2O94898 1065 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 CTSHP09668 335 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 HDXQ7Z353 690 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 PARP2Q9UGN5 583 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 SLITRK5O94991 958 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 CD96P40200 585 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 NKG7Q16617 165 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGEF11O15085 1522 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 WDR62O43379 1518 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 LIG3P49916 1009 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 AOC3Q16853 763 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 TMC4Q7Z404 712 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 PICK1Q9NRD5 415 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 USP31Q70CQ4 1352 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 PAPLNO95428 1278 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms