RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RBM39-242ENST00000498280 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.91□□□□□ -1.62
RBM39-242ENST00000498280 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.91□□□□□ -1.62
RBM39-242ENST00000498280 SULF2Q8IWU5 870 aa4.91□□□□□ -1.62
RBM39-242ENST00000498280 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RBM39-242ENST00000498280 GPBAR1Q8TDU6 330 aa4.91□□□□□ -1.62
RBM39-242ENST00000498280 KIRREL1Q96J84 757 aa4.91□□□□□ -1.62
RBM39-242ENST00000498280 SETDB2Q96T68 719 aa4.91□□□□□ -1.62
RBM39-242ENST00000498280 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RBM39-242ENST00000498280 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.91□□□□□ -1.62
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RBM39-242ENST00000498280 CLCN7P51798 805 aa4.9□□□□□ -1.63
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RBM39-242ENST00000498280 PPM1JQ5JR12 505 aa4.9□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 TMC7Q7Z402 723 aa4.9□□□□□ -1.63
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RBM39-242ENST00000498280 CITED4Q96RK1 184 aa4.9□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 TRAK1Q9UPV9 953 aa4.9□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.9□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.9□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 FBXO24O75426 580 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 C1QTNF9P0C862 333 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 ARNTP27540 789 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 C14orf37Q86TY3 774 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 C12orf40Q86WS4 652 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 RETREG2Q8NC44 543 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 JAG2Q9Y219 1238 aa4.89□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 DCDC2CA8MYV0 355 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 INHBBP09529 407 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 BMP6P22004 513 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 DSC3Q14574 896 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 RNF214Q8ND24 703 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 ARID3AQ99856 593 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 SOWAHDA6NJG2 315 aa4.87□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.87□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 ENC1O14682 589 aa4.87□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 EOMESO95936 686 aa4.87□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 NME2P22392 152 aa4.87□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 CTSWP56202 376 aa4.87□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 ERVK-24P63145 666 aa4.87□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 PPP2R3AQ06190 1150 aa4.87□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 KCNA10Q16322 511 aa4.87□□□□□ -1.63
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RBM39-242ENST00000498280 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.87□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 CCDC120Q96HB5 630 aa4.87□□□□□ -1.63
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RBM39-242ENST00000498280 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 TMEM253P0C7T8 217 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 RING1Q06587 406 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 DIRC2Q96SL1 478 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 EPB41L4BQ9H329 900 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 CD320Q9NPF0 282 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 NLRP2Q9NX02 1062 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 WWC3Q9ULE0 1092 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 PRR33A8MZF0 331 aa4.85□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 GDNFP39905 211 aa4.85□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 CDK8P49336 464 aa4.85□□□□□ -1.63
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RBM39-242ENST00000498280 ACSBG1Q96GR2 724 aa4.85□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.85□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 FOXQ1Q9C009 403 aa4.85□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4.85□□□□□ -1.63
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RBM39-242ENST00000498280 FBRSQ9HAH7 460 aa4.84□□□□□ -1.63
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RBM39-242ENST00000498280 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RBM39-242ENST00000498280 TREHO43280 583 aa4.83□□□□□ -1.64
RBM39-242ENST00000498280 SLITRK5O94991 958 aa4.83□□□□□ -1.64
RBM39-242ENST00000498280 CELA3AP09093 270 aa4.83□□□□□ -1.64
RBM39-242ENST00000498280 MED14OSP0DP75 135 aa4.83□□□□□ -1.64
RBM39-242ENST00000498280 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RBM39-242ENST00000498280 GLDCP23378 1020 aa4.83□□□□□ -1.64
RBM39-242ENST00000498280 PLCB3Q01970 1234 aa4.83□□□□□ -1.64
RBM39-242ENST00000498280 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.83□□□□□ -1.64
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