RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495785.1

SRSF10-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 10, humanhuman

TSL 5

Gene SRSF10, Length 1,390 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF10-215ENST00000495785 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.55□□□□□ -0.88
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SRSF10-215ENST00000495785 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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SRSF10-215ENST00000495785 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.55□□□□□ -0.88
SRSF10-215ENST00000495785 ABCC12Q96J65 1359 aa9.54□□□□□ -0.88
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SRSF10-215ENST00000495785 CRY2Q49AN0 593 aa9.54□□□□□ -0.88
SRSF10-215ENST00000495785 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.54□□□□□ -0.88
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SRSF10-215ENST00000495785 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.54□□□□□ -0.88
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SRSF10-215ENST00000495785 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SRSF10-215ENST00000495785 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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SRSF10-215ENST00000495785 NTSR2O95665 410 aa9.52□□□□□ -0.88
SRSF10-215ENST00000495785 ADH6P28332 368 aa9.52□□□□□ -0.88
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SRSF10-215ENST00000495785 ZNF428Q96B54 188 aa9.51□□□□□ -0.89
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SRSF10-215ENST00000495785 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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SRSF10-215ENST00000495785 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.49□□□□□ -0.89
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SRSF10-215ENST00000495785 GPR37L1O60883 481 aa9.49□□□□□ -0.89
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SRSF10-215ENST00000495785 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.49□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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SRSF10-215ENST00000495785 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.48□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 CNTROBQ8N137 903 aa9.48□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.48□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.48□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.47□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.47□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 AOC3Q16853 763 aa9.47□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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