RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 MYH3P11055 1940 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 HMGCRP04035 888 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 WWC1Q8IX03 1113 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 GREM2Q9H772 168 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 THEGQ9P2T0 379 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF521Q96K83 1311 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 STK25O00506 426 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 CHL1O00533 1208 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF853P0CG23 659 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 TRIB2Q92519 343 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 JAG2Q9Y219 1238 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 RLFQ13129 1914 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CACNA1FO60840 1977 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 GPR37L1O60883 481 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CTSWP56202 376 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 GRIK5Q16478 980 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CXCL11O14625 94 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CACNB3P54284 484 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 EPHB4P54760 987 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 ADGRE1Q14246 886 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 PDE3AQ14432 1141 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 MBIPQ9NS73 344 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 TNNI2P48788 182 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 FAM83AQ86UY5 434 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 WDR63Q8IWG1 891 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 PPM1EQ8WY54 764 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 BADQ92934 168 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 COA7Q96BR5 231 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF576Q9H609 170 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 IFT57Q9NWB7 429 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 HYPKQ9NX55 129 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 IL16Q14005 1332 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CRKP46108 304 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 GNAI1P63096 354 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CHRNDQ07001 517 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 PLPP6Q8IY26 295 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 MYD88Q99836 296 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 MYO9BQ13459 2157 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 HOXB7P09629 217 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 DNAJB2P25686 324 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 ITGB8P26012 769 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 RTP1P59025 263 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 NHLH1Q02575 133 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 USP34Q70CQ2 3546 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TAF5LO75529 589 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 KCNQ1P51787 676 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TFF2Q03403 129 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms