RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 RAET1EQ8TD07 263 aa20.38■□□□□ 0.85
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PTPRU-208ENST00000493601 SIPA1L1O43166 1804 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-208ENST00000493601 FAM196BA6NMK8 535 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRU-208ENST00000493601 DNAJC18Q9H819 358 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRU-208ENST00000493601 PALD1Q9ULE6 856 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRU-208ENST00000493601 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 BACE1P56817 501 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.25■□□□□ 0.83
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