RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 OGFOD2Q6N063 350 aa5.68□□□□□ -1.5
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RARB-208ENST00000489694 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.68□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 KIF14Q15058 1648 aa5.67□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 PTPN23Q9H3S7 1636 aa5.67□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 GRM2Q14416 872 aa5.67□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 PI16Q6UXB8 463 aa5.67□□□□□ -1.5
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RARB-208ENST00000489694 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.67□□□□□ -1.5
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RARB-208ENST00000489694 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.66□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 TMPRSS2O15393 492 aa5.66□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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RARB-208ENST00000489694 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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RARB-208ENST00000489694 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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RARB-208ENST00000489694 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.65□□□□□ -1.5
RARB-208ENST00000489694 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa5.65□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 ABCC10Q5T3U5 1492 aa5.64□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.64□□□□□ -1.51
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RARB-208ENST00000489694 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 FZD5Q13467 585 aa5.64□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.64□□□□□ -1.51
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RARB-208ENST00000489694 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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RARB-208ENST00000489694 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.64□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 PIDD1Q9HB75 910 aa5.64□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.64□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 ADGRL2O95490 1459 aa5.64□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 ZNF862O60290 1169 aa5.63□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 FAM87AP0C7U9 286 aa5.63□□□□□ -1.51
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RARB-208ENST00000489694 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.63□□□□□ -1.51
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RARB-208ENST00000489694 SPRED2Q7Z698 418 aa5.62□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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RARB-208ENST00000489694 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
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RARB-208ENST00000489694 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.62□□□□□ -1.51
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RARB-208ENST00000489694 FCGRTP55899 365 aa5.61□□□□□ -1.51
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RARB-208ENST00000489694 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.61□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 DISC1Q9NRI5 854 aa5.61□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 PREX2Q70Z35 1606 aa5.6□□□□□ -1.51
RARB-208ENST00000489694 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.6□□□□□ -1.51
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