RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 CILPO75339 1184 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 NEFMP07197 916 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 USP48Q86UV5 1035 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 ZNF428Q96B54 188 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 GARTP22102 1010 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 CDK8P49336 464 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 CYP27A1Q02318 531 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 MPP2Q14168 576 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 ARTNQ5T4W7 220 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 ZAR1Q86SH2 424 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 ATG3Q9NT62 314 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 GREM1O60565 184 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 NTF4P34130 210 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 HID1Q8IV36 788 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 LRRC3Q9BY71 257 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 LGR6Q9HBX8 967 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.36□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.36□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 FBXL6Q8N531 539 aa7.36□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 REC114Q7Z4M0 266 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 LRIG2O94898 1065 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 F13BP05160 661 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 ADMP35318 185 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 CAP2P40123 477 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 APOBRQ0VD83 1088 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 CDK5R2Q13319 367 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 GRIK1P39086 918 aa7.33□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 MLECQ14165 292 aa7.33□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 FOXQ1Q9C009 403 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 FAM87AP0C7U9 286 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 NBPF11Q86T75 865 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 NKD1Q969G9 470 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 FBRSQ9HAH7 460 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.32□□□□□ -1.24
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