RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 CILPO75339 1184 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 NEFMP07197 916 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 USP48Q86UV5 1035 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-204ENST00000487939 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
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PTEN-204ENST00000487939 ZNF428Q96B54 188 aa7.4□□□□□ -1.22
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PTEN-204ENST00000487939 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 CYP27A1Q02318 531 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 ZAR1Q86SH2 424 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 LRRC3Q9BY71 257 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 F13BP05160 661 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 ADMP35318 185 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 CAP2P40123 477 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 APOBRQ0VD83 1088 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 CDK5R2Q13319 367 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-204ENST00000487939 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTEN-204ENST00000487939 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 MLECQ14165 292 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 FOXQ1Q9C009 403 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 FAM87AP0C7U9 286 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 NBPF11Q86T75 865 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 NKD1Q969G9 470 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 FBRSQ9HAH7 460 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.32□□□□□ -1.24
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