RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487411.5

STX4-210, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene STX4, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-210ENST00000487411 USP5P45974 858 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 CRHR2Q13324 411 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.979e-9■■■■■ 29.2
STX4-210ENST00000487411 MCOLN1Q9GZU1 580 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 PALD1Q9ULE6 856 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 DGKZQ13574 1117 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 BTBD19C9JJ37 291 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 CXCL11O14625 94 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 FKTNO75072 461 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 HLA-DOAP06340 250 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 GCC1Q96CN9 775 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 DNAJC18Q9H819 358 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 ZHX2Q9Y6X8 837 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 ABHD8Q96I13 439 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 CAP2P40123 477 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 UBE3CQ15386 1083 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-210ENST00000487411 MOGSQ13724 837 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 ANKRD23Q86SG2 305 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 LCORLQ8N3X6 602 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 TRIM34Q9BYJ4 488 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 PHIPQ8WWQ0 1821 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 MYH1P12882 1939 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 MYH7P12883 1935 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 EHD4Q9H223 541 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 NAV1Q8NEY1 1877 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 ERC2O15083 957 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 MBD4O95243 580 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 CHGBP05060 677 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 MX1P20591 662 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 TTC6Q86TZ1 520 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 ARMT1Q9H993 441 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 ATAD5Q96QE3 1844 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 CAPN15O75808 1086 aa27.28■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 TRIM75PA6NK02 468 aa27.27■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 SDR42E1Q8WUS8 393 aa27.27■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 GINM1Q9NU53 330 aa27.27■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 SERPINB13Q9UIV8 391 aa27.27■■□□□ 1.96
STX4-210ENST00000487411 PTPRFP10586 1907 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 USP17L5A8MUK1 530 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 PDHXO00330 501 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 TLR2O60603 784 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 ASNSP08243 561 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 SP3Q02447 781 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 GPAT2Q6NUI2 795 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 ERO1AQ96HE7 468 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 SMC5Q8IY18 1101 aa27.25■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 PLCD1P51178 756 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 TATDN1Q6P1N9 297 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 ZNF280CQ8ND82 737 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 ADGRA2Q96PE1 1338 aa27.23■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 GDF11O95390 407 aa27.23■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 JAG1P78504 1218 aa27.23■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 SPP2Q13103 211 aa27.23■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.23■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.23■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.23■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 PRKAB2O43741 272 aa27.22■■□□□ 1.95
STX4-210ENST00000487411 GABPAQ06546 454 aa27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms