RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 ANO1Q5XXA6 986 aa15.38■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 PSMA7O14818 248 aa15.37■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 N4BP3O15049 544 aa15.37■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 SASH1O94885 1247 aa15.37■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.051e-6■■□□□ 14
NISCH-207ENST00000479054 ADCK5Q3MIX3 580 aa15.37■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.056e-7■■□□□ 14
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NISCH-207ENST00000479054 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.37■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 ATG3Q9NT62 314 aa15.37■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.37■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.37■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.37■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.36■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 PPP1R2P41236 205 aa15.36■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 SLC1A4P43007 532 aa15.36■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.36■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 PIGBQ92521 554 aa15.36■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.36■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 PLVAPQ9BX97 442 aa15.36■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 SEMA3EO15041 775 aa15.36■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 GTF2IP78347 998 aa15.36■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 ASIC1P78348 528 aa15.36■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.35■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 USP40Q9NVE5 1235 aa15.35■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 XDHP47989 1333 aa15.35■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 MTX1Q13505 466 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 SYNCQ9H7C4 482 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 BCAMP50895 628 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 HOOK3Q86VS8 718 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 GBP3Q9H0R5 595 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.35■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 MTMR6Q9Y217 621 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 CPS1P31327 1500 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 FAM193AP78312 1265 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.34■□□□□ 0.05
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NISCH-207ENST00000479054 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 PFKFB2O60825 505 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 SERPINB2P05120 415 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 KRT40Q6A162 431 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 BICDL2A1A5D9 508 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 PAFAH1B1P43034 410 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 UBE4AQ14139 1066 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 TAF12Q16514 161 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 CCDC93Q567U6 631 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-207ENST00000479054 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.056e-8■■■■□ 19.7
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