RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476860.1

MFSD1-211, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-211ENST00000476860 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.38□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.38□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 SCRIBQ14160 1630 aa6.38□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF862O60290 1169 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 AOC2O75106 756 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 TRIM37O94972 964 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 ADH5P11766 374 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 RNF34Q969K3 372 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 RHOVQ96L33 236 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 TMEM74Q96NL1 305 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 RAD18Q9NS91 495 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.37□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 FAM170BA6NMN3 283 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 PAPLNO95428 1278 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 TCF3P15923 654 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 USP11P51784 963 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 SEPT6Q14141 434 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 RELL1Q8IUW5 271 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.36□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.35□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.35□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 PF4P02776 101 aa6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 SLFN14P0C7P3 912 aa6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 ID3Q02535 119 aa6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 LMNB2Q03252 620 aa6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 USP48Q86UV5 1035 aa6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 FLCNQ8NFG4 579 aa6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.34□□□□□ -1.39
MFSD1-211ENST00000476860 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 TMPRSS2O15393 492 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 CYP27A1Q02318 531 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 MAP7Q14244 749 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF394Q53GI3 561 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 LCE4AQ5TA78 99 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.33□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 NFICP08651 508 aa6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 DYMQ7RTS9 669 aa6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 GARTP22102 1010 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 BPNT1O95861 308 aa6.3□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 F13A1P00488 732 aa6.3□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 RAB6AP20340 208 aa6.3□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 CDK8P49336 464 aa6.3□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 ERVK-24P63145 666 aa6.3□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 INPP5AQ14642 412 aa6.3□□□□□ -1.4
MFSD1-211ENST00000476860 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms