RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 PICK1Q9NRD5 415 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 JAG2Q9Y219 1238 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 RAG1P15918 1043 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 CASP7P55210 303 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 GNAI1P63096 354 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 FPGSQ05932 587 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 PRRX2Q99811 253 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-208ENST00000476423 KBTBD13C9JR72 458 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 RGS20O76081 388 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 KSR2Q6VAB6 950 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 MRIQ9BWK5 157 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 PBX4Q9BYU1 374 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CDH23Q9H251 3354 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 ITGA6P23229 1130 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 RGS2P41220 211 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 FAM151AQ8WW52 585 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TEKT1Q969V4 418 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 H7C1W4 665 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CHRNDQ07001 517 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 GCKRQ14397 625 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 SNX17Q15036 470 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 HLA-CQ95604 372 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 KIAA0355O15063 1070 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TAF5LO75529 589 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CLTBP09497 229 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 PTPRAP18433 802 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CNGA1P29973 690 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 MAPK4P31152 587 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 PTPN5P54829 565 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TRIM60Q495X7 471 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 AK9Q5TCS8 1911 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 GFRA3O60609 400 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CACNB3P54284 484 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 EPHB4P54760 987 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 FLIIQ13045 1269 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 GJD3Q8N144 294 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 ZDHHC15Q96MV8 337 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 UTYO14607 1347 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 MAST3O60307 1309 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 F6X3S4 739 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CSF1RP07333 972 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 PBX2P40425 430 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TLE2Q04725 743 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 APBA2Q99767 749 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 STK31Q9BXU1 1019 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 RLFQ13129 1914 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 FOXO4P98177 505 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 GRIK5Q16478 980 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 PKN1Q16512 942 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-208ENST00000476423 WWC1Q8IX03 1113 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms