RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475103.5

RBMS1-210, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 3

Gene RBMS1, Length 414 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-210	ENST00000475103	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RBMS1-210	ENST00000475103	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	CSAD	Q9Y600	493 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	GNA15	P30679	374 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	CAP2	P40123	477 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	AOC3	Q16853	763 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	EOMES	O95936	686 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	FGD1	P98174	961 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	BIN1	O00499	593 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	INPP5A	Q14642	412 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	OGFOD2	Q6N063	350 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	LRIG2	O94898	1065 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBMS1-210	ENST00000475103	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	CD96	P40200	585 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	HDX	Q7Z353	690 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	PICK1	Q9NRD5	415 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	ASB11	Q8WXH4	323 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	CLCN7	P51798	805 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	SLITRK5	O94991	958 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	FOXQ1	Q9C009	403 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	ITIH2	P19823	946 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	GFRA2	O00451	464 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBMS1-210	ENST00000475103	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	HID1	Q8IV36	788 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	NKG7	Q16617	165 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	RNF19A	Q9NV58	838 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	CDK8	P49336	464 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	C8A	P07357	584 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	LIG3	P49916	1009 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	FAM168A	Q92567	244 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-210	ENST00000475103	RLBP1	P12271	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBMS1-210	ENST00000475103	DAB2	P98082	770 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBMS1-210	ENST00000475103	ZP2	Q05996	745 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBMS1-210	ENST00000475103	IKZF1	Q13422	519 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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