RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 PICK1Q9NRD5 415 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 GINM1Q9NU53 330 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 IGHDP01880 384 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 NUCB1Q02818 461 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 OTUD5Q96G74 571 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 EHD4Q9H223 541 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 TRPA1O75762 1119 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 CETPP11597 493 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 PDE1AP54750 535 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 SNAPC2Q13487 334 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 IFNL1Q8IU54 200 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-203ENST00000474160 CXCL11O14625 94 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 APPBP2Q92624 585 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 IRF6O14896 467 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 LNPKQ9C0E8 428 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 PALD1Q9ULE6 856 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 MBD4O95243 580 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 LCORLQ8N3X6 602 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 EVI5LQ96CN4 794 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 MYH1P12882 1939 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 PTPRAP18433 802 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 CAP2P40123 477 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 CCL15Q16663 113 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 DOCK1Q14185 1865 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 ASNSP08243 561 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 GNAT2P19087 354 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 FSD1Q9BTV5 496 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 ARMT1Q9H993 441 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 SIPA1L1O43166 1804 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-203ENST00000474160 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 PTPN18Q99952 460 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC18Q9H819 358 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 TSKSQ9UJT2 592 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 FAM196BA6NMK8 535 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 USP17L5A8MUK1 530 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 GABPAQ06546 454 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 OSBP2Q969R2 916 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 SWAP70Q9UH65 585 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D8O95759 1140 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 WDR18Q9BV38 432 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 GPR25O00155 361 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 GPAA1O43292 621 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 SLURP2P0DP57 97 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 PLCD1P51178 756 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 BTBD19C9JJ37 291 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 CHGBP05060 677 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 SBK1Q52WX2 424 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-203ENST00000474160 PRKAB2O43741 272 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 CRHR2Q13324 411 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.2 ms