RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 CNTROBQ8N137 903 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 PRAM1Q96QH2 718 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 USP47Q96K76 1375 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC7Q96M83 1385 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 MUC3AQ02505 3323 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 SLIT3O75094 1523 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 CENPFP49454 3210 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 EYSQ5T1H1 3165 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 LGR5O75473 907 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP3K6O95382 1288 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO11Q86XK2 927 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 NSD2O96028 1365 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 C4BP0C0L5 1744 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 IGFBP4P22692 258 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 INPP5BP32019 993 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 IDH3AP50213 366 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 PERM1Q5SV97 790 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 NLRP13Q86W25 1043 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 KLK14Q9P0G3 267 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 NUP155O75694 1391 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-203ENST00000459697 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 LAMA3Q16787 3333 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 H0YGN5 161 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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RABGGTB-203ENST00000459697 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.272e-23■■■■■ 43.2
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RABGGTB-203ENST00000459697 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.14□□□□□ -1.27
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RABGGTB-203ENST00000459697 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.14□□□□□ -1.27
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RABGGTB-203ENST00000459697 ZFATQ9P243 1243 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 SASH3O75995 380 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 RARAP10276 462 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 IL2RBP14784 551 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 SSFA2P28290 1259 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 NOS3P29474 1203 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 ARSDP51689 593 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC9Q92623 222 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 IFT43Q96FT9 208 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 C4AP0C0L4 1744 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGGTB-203ENST00000459697 PLAURQ03405 335 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 PTK7Q13308 1070 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 NFKBIEO00221 500 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 MICAL2O94851 1124 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF112Q9ULX5 631 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 SCN4AP35499 1836 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa7.1□□□□□ -1.27
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