RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	PTPRA	P18433	802 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	USP5	P45974	858 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	HAUS7	Q99871	368 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	DOCK1	Q14185	1865 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		29	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	IGSF3	O75054	1194 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	MOGS	Q13724	837 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	DNAJC18	Q9H819	358 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYH1	P12882	1939 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	JAG1	P78504	1218 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	CAP1	Q01518	475 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	LCORL	Q8N3X6	602 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARMT1	Q9H993	441 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIM75P	A6NK02	468 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	ADD2	P35612	726 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	EVX2	Q03828	476 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	GDF11	O95390	407 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	CAP2	P40123	477 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	PDHX	O00330	501 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	CXCL11	O14625	94 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	HLA-DOA	P06340	250 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	PRKAB2	O43741	272 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	MBD4	O95243	580 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	SP3	Q02447	781 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	GPATCH3	Q96I76	525 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIM17	Q9Y577	477 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLCD1	P51178	756 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	SPP2	Q13103	211 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	CERS3	Q8IU89	383 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	28.9	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	CPA4	Q9UI42	421 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYH7	P12883	1935 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	PTPRF	P10586	1907 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP2D6	P10635	497 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SH3BP5-208	ENST00000459627	TLR2	O60603	784 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP2C8	P10632	490 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	ERO1A	Q96HE7	468 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	USP17L5	A8MUK1	530 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	SMIM22	K7EJ46	135 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	UBE3C	Q15386	1083 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	TREML2	Q5T2D2	321 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	TTC6	Q86TZ1	520 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	HMGCS2	P54868	508 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	EFCC1	Q9HA90	598 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	IGHD	P01880	384 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21

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