RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MTFR1Q15390 333 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TEX11Q8IYF3 940 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DNAJC18Q9H819 358 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PICK1Q9NRD5 415 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PALD1Q9ULE6 856 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DOCK2Q92608 1830 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CHGBP05060 677 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CYP7A1P22680 504 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CAP2P40123 477 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPP4CP60510 307 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRKCZQ05513 592 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AACSQ86V21 672 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SIPA1L1O43166 1804 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HMGCS2P54868 508 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIF22Q14807 665 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SRRDQ9UH36 339 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FLT1P17948 1338 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GDF11O95390 407 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DOCK1Q14185 1865 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYPNQ86TC9 1320 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PTPRFP10586 1907 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMIM22K7EJ46 135 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC34A2O95436 690 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BAG3O95817 575 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ELNP15502 786 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NBPF11Q86T75 865 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SHISA4Q96DD7 197 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP17L5A8MUK1 530 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GRK4P32298 578 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FLT3LGP49771 235 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLCD1P51178 756 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FCGRTP55899 365 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MTMR2Q13614 643 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGEF6Q15052 776 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RAET1EQ8TD07 263 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GNRH1P01148 92 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CYP2D6P10635 497 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCL5P13501 91 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP5P45974 858 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRIM32Q13049 653 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 Q3C1V9 767 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MGAMO43451 1857 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GOLIM4O00461 696 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRKAB2O43741 272 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADCY3O60266 1144 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GH2P01242 217 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PDE6AP16499 860 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLCG2P16885 1265 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HOXD10P28358 340 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms