RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 INHBEP58166 350 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 TFCP2Q12800 502 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRO3102Q9H379 93 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 EYA2O00167 538 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC27A2O14975 620 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 STX6O43752 255 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 CASP7P55210 303 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 NECTIN1Q15223 517 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 GORABQ5T7V8 394 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.44□□□□□ -1.22
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SHQ1P1-201ENST00000437111 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 FZD1Q9UP38 647 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0D9SFI3 127 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 G3V3G9 751 aa7.43□□□□□ -1.22
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SHQ1P1-201ENST00000437111 RPS6KB1P23443 525 aa7.43□□□□□ -1.22
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SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXO4P98177 505 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 SP3Q02447 781 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRHR2Q13324 411 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 WNK4Q96J92 1243 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 WNT10BO00744 389 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 UFL1O94874 794 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 F13A1P00488 732 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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SHQ1P1-201ENST00000437111 PTH1RQ03431 593 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 PKP1Q13835 747 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPHA10Q5JZY3 1008 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 NBPF11Q86T75 865 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 DPF3Q92784 378 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM227BQ96M60 508 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL25Q9H293 177 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSME4Q14997 1843 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GUL6 1792 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP17L3A6NCW0 530 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP17L4A6NCW7 530 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 GJB2P29033 226 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 GJA5P36382 358 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2HP62256 183 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT85P78386 507 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP3K11Q16584 847 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM89AQ96GI7 184 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRCH3Q96II8 777 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEK1Q96PY6 1258 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPN18Q99952 460 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 MXD3Q9BW11 206 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 GGA1Q9UJY5 639 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.42□□□□□ -1.22
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