RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa15.61■□□□□ 0.09
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SGMS1-203ENST00000429490 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.61■□□□□ 0.09
SGMS1-203ENST00000429490 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.61■□□□□ 0.09
SGMS1-203ENST00000429490 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
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SGMS1-203ENST00000429490 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.082e-16■■■■■ 102.3
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SGMS1-203ENST00000429490 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.56■□□□□ 0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 PPP6R2O75170 966 aa15.56■□□□□ 0.08
SGMS1-203ENST00000429490 KRT2P35908 639 aa15.56■□□□□ 0.08
SGMS1-203ENST00000429490 PLA2G4AP47712 749 aa15.56■□□□□ 0.08
SGMS1-203ENST00000429490 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.56■□□□□ 0.08
SGMS1-203ENST00000429490 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.56■□□□□ 0.08
SGMS1-203ENST00000429490 ITSN1Q15811 1721 aa15.56■□□□□ 0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.55■□□□□ 0.08
SGMS1-203ENST00000429490 TSPY2A6NKD2 308 aa15.55■□□□□ 0.08
SGMS1-203ENST00000429490 POTEB2H3BUK9 544 aa15.55■□□□□ 0.08
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