RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.9□□□□□ -0.66
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KCNH6Q9H252 994 aa10.9□□□□□ -0.66
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.9□□□□□ -0.66
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRR33A8MZF0 331 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RAG1P15918 1043 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CNGA1P29973 690 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAP3K10Q02779 954 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FPGSQ05932 587 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ADGRE1Q14246 886 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SNX17Q15036 470 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRIM60Q495X7 471 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC174Q6PII3 467 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HERVK_113Q902F9 699 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 APBA2Q99767 749 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.89□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PI4K2BG5E9Z4 385 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ERC2O15083 957 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EPHB4P54760 987 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CASP7P55210 303 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NHLH1Q02575 133 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCL14Q16627 93 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MORN1Q5T089 497 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MSRAQ9UJ68 235 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LTBP2Q14767 1821 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAST2Q6P0Q8 1798 aa10.88□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UTYO14607 1347 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM86C2PA6NEL3 165 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIAA0355O15063 1070 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KCNQ1P51787 676 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TFF2Q03403 129 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NFIAQ12857 509 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SPP2Q13103 211 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PBX4Q9BYU1 374 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MBIPQ9NS73 344 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 USP40Q9NVE5 1235 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM198AQ9UFP1 575 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 COG5Q9UP83 839 aa10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ENTPD3O75355 529 aa10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CLTBP09497 229 aa10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ATP2B2Q01814 1243 aa10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TLE2Q04725 743 aa10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAP2K5Q13163 448 aa10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RAB30Q15771 203 aa10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GPR142Q7Z601 462 aa10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AK9Q5TCS8 1911 aa10.86□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ITGB8P26012 769 aa10.85□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HMGCS2P54868 508 aa10.85□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FOXO4P98177 505 aa10.85□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.85□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WDR66Q8TBY9 1149 aa10.85□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa10.85□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.85□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TLL1O43897 1013 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ST18O60284 1047 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PBX2P40425 430 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ADCYAP1R1P41586 468 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ERVK-9P63128 1117 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ERVK-24P63145 666 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZFPM1Q8IX07 1006 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MICALL1Q8N3F8 863 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LINS1Q8NG48 757 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IDI2Q9BXS1 227 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 STK31Q9BXU1 1019 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC28A3Q9HAS3 691 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AS3MTQ9HBK9 375 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.84□□□□□ -0.67
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TBC1D12O60347 775 aa10.83□□□□□ -0.68
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RGS3P49796 1198 aa10.83□□□□□ -0.68
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HERVK_113P62684 666 aa10.83□□□□□ -0.68
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GNAI1P63096 354 aa10.83□□□□□ -0.68
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCNA1P78396 465 aa10.83□□□□□ -0.68
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms