RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 TREML2Q5T2D2 321 aa16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC3-201ENST00000373159 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC3-201ENST00000373159 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC3-201ENST00000373159 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 CAP2P40123 477 aa16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 GORABQ5T7V8 394 aa16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 DEFB118Q96PH6 123 aa16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM196BA6NMK8 535 aa16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 PI16Q6UXB8 463 aa16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAI14Q9P0K7 980 aa16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 USP17L5A8MUK1 530 aa16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 GNAI2P04899 355 aa16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 GJD2Q9UKL4 321 aa16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 DOCK2Q92608 1830 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 EVI5O60447 810 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 MCAMP43121 646 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 HMGCS2P54868 508 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 TEX11Q8IYF3 940 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 WDR18Q9BV38 432 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PPC1 479 aa16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP4CP60510 307 aa16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 MGAMO43451 1857 aa16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 BAG3O95817 575 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRIM27P14373 513 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPR108Q9NPR9 543 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 DOCK1Q14185 1865 aa16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTPRFP10586 1907 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGSF3O75054 1194 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 HMGCRP04035 888 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLCG2P16885 1265 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 BACE1P56817 501 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 GINM1Q9NU53 330 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPTORQ8N122 1335 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 C19orf81C9J6K1 198 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 ASNSP08243 561 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCER2I3L3R5 266 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 JAG1P78504 1218 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 POLA2Q14181 598 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 SNRKQ9NRH2 765 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 STAP2Q9UGK3 403 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 TNNQ9UQP3 1299 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 LAMA3Q16787 3333 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 BCAR3O75815 825 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATP8B2P98198 1209 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 MTMR2Q13614 643 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 TNNI3KQ59H18 835 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 DNAJC18Q9H819 358 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 USP17L10C9JJH3 530 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms