RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372621.8

CTPS1-202, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-202ENST00000372621 TMEM139Q8IV31 216 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 MYH6P13533 1939 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 TMEM232C9JQI7 657 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 SLC5A1P13866 664 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 GRIN1Q05586 938 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 MTA3Q9BTC8 594 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 CCP110O43303 1012 aa14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 PRKAB2O43741 272 aa14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 CFAP100Q494V2 611 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTPS1-202ENST00000372621 SNAP23O00161 211 aa14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 FANCGO15287 622 aa14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 LCORLQ8N3X6 602 aa14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 PHLPP1O60346 1717 aa14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-202ENST00000372621 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 GNAT2P19087 354 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 RCAN1P53805 252 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SPECC1Q5M775 1068 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF18P17022 549 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 HSPA2P54652 639 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 POSTNQ15063 836 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 RTN1Q16799 776 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.074e-7■■□□□ 13.6
CTPS1-202ENST00000372621 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 MORC3Q14149 939 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 WTAPQ15007 396 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 LAMB2P55268 1798 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 DEXIO95424 95 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 PRR29P0C7W0 189 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SUSD4Q5VX71 490 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SPATA20Q8TB22 786 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTPS1-202ENST00000372621 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 KIF20AO95235 890 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 NR5A1Q13285 461 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 TMTC2Q8N394 836 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 MED15Q96RN5 788 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 BTG4Q9NY30 223 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 TDO2P48775 406 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 PTPN21Q16825 1174 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 MLKLQ8NB16 471 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SHISA4Q96DD7 197 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 ARHGAP6O43182 974 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 BCAMP50895 628 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 HOMER1Q86YM7 354 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 KRT222Q8N1A0 295 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 FANCBQ8NB91 859 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 DNAI1Q9UI46 699 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 STRCQ7RTU9 1775 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 OXER1Q8TDS5 423 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 RTL9Q8NET4 1388 aa14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 RREB1Q92766 1687 aa14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-202ENST00000372621 SEC23AQ15436 765 aa14.6□□□□□ -0.07
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