RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 AIDAQ96BJ3 306 aa21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 SNAP23O00161 211 aa21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 USP49Q70CQ1 688 aa21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 STK36Q9NRP7 1315 aa21.56■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 PDE8BO95263 885 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MMP1P03956 469 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 IL2RBP14784 551 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 NR5A1Q13285 461 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 DESI2Q9BSY9 194 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 ZSCAN12O43309 604 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MBD4O95243 580 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MYH3P11055 1940 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 PRKAB2O43741 272 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 LIFRP42702 1097 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 ARMT1Q9H993 441 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MYO1BO43795 1136 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 IFNAR1P17181 557 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 PTPREP23469 700 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 GNG11P61952 73 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MORC3Q14149 939 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MTF1Q14872 753 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 OXER1Q8TDS5 423 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 KIFC2Q96AC6 838 aa21.54■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 DCCP43146 1447 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 SASH3O75995 380 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 ALX1Q15699 326 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 NAPBQ9H115 298 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 ATP2B1P20020 1258 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 SHISA4Q96DD7 197 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MAP3K9P80192 1104 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 PIGBQ92521 554 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-201ENST00000367651 A0A0U1RQJ8 604 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 FAM205CA6NFA0 338 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CASQ1P31415 396 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 SMARCE1Q969G3 411 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 STRN4Q9NRL3 753 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 STX10O60499 249 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 RASGRF1Q13972 1273 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 NID2Q14112 1375 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 A0A087X0B3 334 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 RTN1Q16799 776 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 MLKLQ8NB16 471 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 SPATA5Q8NB90 893 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 DOCK2Q92608 1830 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 TEX33O43247 280 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D8O95759 1140 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 FGFR2P21802 821 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 DHX58Q96C10 678 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CSRNP2Q9H175 543 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 RAI14Q9P0K7 980 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CASP1P29466 404 aa21.49■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.49■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 TEX35Q5T0J7 233 aa21.49■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 LCORLQ8N3X6 602 aa21.49■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 TOMM22Q9NS69 142 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms