RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GCP02774 474 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADH4P08319 380 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HOXB7P09629 217 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 USP17L8P0C7I0 530 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 THRBP10828 461 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MX2P20592 715 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIR2DS2P43631 304 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPM6AP51674 278 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP12-1P59990 96 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LMO4P61968 165 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RHDQ02161 417 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FOXE3Q13461 319 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SS18Q15532 418 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHPFQ8IZ52 775 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 JMYQ8N9B5 988 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM52Q8NDY8 209 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIF12Q96FN5 646 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTPALQ9BTX7 342 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF38Q9H0F5 515 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 USP21Q9UK80 565 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCTD3Q9Y597 815 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NFS1Q9Y697 457 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CACNA1EQ15878 2313 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GAKO14976 1311 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRR36Q9H6K5 1346 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC35F4A4IF30 521 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC22A31A6NKX4 558 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IFITM10A6NMD0 228 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZAR1LA6NP61 321 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 G3V3G9 751 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 J3KR12 359 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPR25O00155 361 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIAA0355O15063 1070 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPP1R37O75864 691 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HRGP04196 525 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV3-11P04433 115 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SP9P0CG40 484 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SELPP16109 830 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF32P17041 273 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RHCEP18577 417 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDC25CP30307 473 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAP2K3P46734 347 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADPRHP54922 357 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZXDBP98169 803 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FUT7Q11130 342 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NFIAQ12857 509 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RTN1Q16799 776 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MSMPQ1L6U9 139 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VMACQ2NL98 169 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DCAF8Q5TAQ9 597 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF449Q6P9G9 518 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FOXR1Q6PIV2 292 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC185Q8N715 623 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 Q8N7P7 452 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRIM63Q969Q1 353 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBTB8AQ96BR9 441 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC26A8Q96RN1 970 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EPG5Q9HCE0 2579 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 APCP25054 2843 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A087WYN8 130 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ESPNB1AK53 854 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WNT7AO00755 349 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LATO43561 262 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV1-39P01597 117 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LMNAP02545 664 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV1D-39P04432 117 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC4A2P04920 1241 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF224P0DH78 156 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GM2AP17900 193 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARRB2P32121 409 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPP4CP60510 307 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CFHR1Q03591 330 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FSTL1Q12841 308 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MIIPQ5JXC2 388 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPDYAQ5MJ70 313 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STRIP1Q5VSL9 837 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCARA3Q6AZY7 606 aa-1.36□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms