RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC18Q9H819 358 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 ARMT1Q9H993 441 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 DOCK1Q14185 1865 aa18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PPIL2Q13356 520 aa18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 LNPKQ9C0E8 428 aa18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 MYH1P12882 1939 aa18.06■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 NAV1Q8NEY1 1877 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 MBD4O95243 580 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 GTF2A2P52657 109 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 INHBEP58166 350 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PPATQ06203 517 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 UBE3CQ15386 1083 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CCL15Q16663 113 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PI4KBQ9UBF8 816 aa18.05■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 ERC2O15083 957 aa18.04■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PRKAB2O43741 272 aa18.04■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PTPRAP18433 802 aa18.04■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-DOAP06340 250 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PDE1AP54750 535 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 EVX2Q03828 476 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 SNAPC2Q13487 334 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 STAP2Q9UGK3 403 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PHIPQ8WWQ0 1821 aa18.02■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.02■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 TNS4Q8IZW8 715 aa18.02■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 OSBP2Q969R2 916 aa18.02■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CFHR5Q9BXR6 569 aa18.02■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PICK1Q9NRD5 415 aa18.02■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 ZHX2Q9Y6X8 837 aa18.02■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 BTBD19C9JJ37 291 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ALDH1A1P00352 501 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CETPP11597 493 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CAP2P40123 477 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 PLCD1P51178 756 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 JAG1P78504 1218 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 NUCB1Q02818 461 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MOGSQ13724 837 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GPR25O00155 361 aa18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GDF11O95390 407 aa18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CYP2D6P10635 497 aa18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CRHR2Q13324 411 aa18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 APPBP2Q92624 585 aa18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MCM9Q9NXL9 1143 aa18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa18■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 M0R2C6 588 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 FSD1Q9BTV5 496 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 EHD4Q9H223 541 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 PTPRFP10586 1907 aa17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM75PA6NK02 468 aa17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM22K7EJ46 135 aa17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CXCL11O14625 94 aa17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TTC6Q86TZ1 520 aa17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SERPINB13Q9UIV8 391 aa17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa17.98■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa17.97■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SHMT1P34896 483 aa17.97■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GABPAQ06546 454 aa17.97■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa17.97■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GPAA1O43292 621 aa17.96■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GPAT2Q6NUI2 795 aa17.96■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TATDN1Q6P1N9 297 aa17.96■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD23Q86SG2 305 aa17.96■□□□□ 0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SLC44A5Q8NCS7 719 aa17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms