RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353284.7

PTPRS-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-202ENST00000353284 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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PTPRS-202ENST00000353284 BTBD18B2RXH4 712 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 BAG3O95817 575 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTPRS-202ENST00000353284 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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PTPRS-202ENST00000353284 PAF1Q8N7H5 531 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.53□□□□□ -0.24
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PTPRS-202ENST00000353284 TLDC2A0PJX2 215 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 GOLGA6BA6NDN3 693 aa13.52□□□□□ -0.24
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PTPRS-202ENST00000353284 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 PDE4DQ08499 809 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 C8orf74Q6P047 294 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 CCDC114Q96M63 670 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRS-202ENST00000353284 ATP1A3P13637 1013 aa13.52□□□□□ -0.25
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PTPRS-202ENST00000353284 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 10.1
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PTPRS-202ENST00000353284 STX10O60499 249 aa13.52□□□□□ -0.25
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PTPRS-202ENST00000353284 DDIT3P35638 169 aa13.52□□□□□ -0.25
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PTPRS-202ENST00000353284 CPLX4Q7Z7G2 160 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 SIRT1Q96EB6 747 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.51□□□□□ -0.25
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PTPRS-202ENST00000353284 RPAINQ86UA6 219 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 PREX2Q70Z35 1606 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 KRT79Q5XKE5 535 aa13.51□□□□□ -0.25
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PTPRS-202ENST00000353284 SMIM23A6NLE4 172 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 ATP7BP35670 1465 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 CETN2P41208 172 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 UBE4AQ14139 1066 aa13.51□□□□□ -0.25
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PTPRS-202ENST00000353284 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 LTKP29376 864 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRS-202ENST00000353284 A0A1B0GUA9 196 aa13.49□□□□□ -0.25
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