RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 TEKT1Q969V4 418 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 KRT23Q9C075 422 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 B4E1Z4 1266 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 USP17L12C9JPN9 530 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 USP17L21D6R901 530 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 CRKP46108 304 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 FBXL16Q8N461 479 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.1□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 TAF3Q5VWG9 929 aa7.1□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 CYP2D6P10635 497 aa7.1□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.09□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 NECAB1Q8N987 351 aa7.09□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 TMEM87BQ96K49 555 aa7.09□□□□□ -1.28
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CCR6-201ENST00000341935 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.09□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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CCR6-201ENST00000341935 EVCP57679 992 aa7.08□□□□□ -1.28
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CCR6-201ENST00000341935 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.08□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.07□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.07□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 MTA3Q9BTC8 594 aa7.07□□□□□ -1.28
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