RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 H7C1W4 665 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 RBL2Q08999 1139 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 KANK3Q6NY19 840 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 MYH7P12883 1935 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 CIAO1O76071 339 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF827Q17R98 1081 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 PHKBQ93100 1093 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 FOXR1Q6PIV2 292 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC35F6Q8N357 371 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 PPM1EQ8WY54 764 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC51Q96ER9 411 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 MFAP3LO75121 409 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC24Q50LG9 513 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 SPECC1Q5M775 1068 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 MED15Q96RN5 788 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 GCP02774 474 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 CORO7P57737 925 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 APOA5Q6Q788 366 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC31Q6UY01 552 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 CNGA4Q8IV77 575 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A0U1RQJ8 604 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 TEX33O43247 280 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP1CC-201ENST00000335007 PBX1P40424 430 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 WDR93Q6P2C0 686 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 VIPAS39Q9H9C1 493 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPREP23469 700 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 STK36Q9NRP7 1315 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 TJP1Q07157 1748 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 GPAA1O43292 621 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 FILIP1LQ4L180 1135 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA1Q5VX52 437 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 PACS2Q86VP3 889 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 CPLX3Q8WVH0 158 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 UBN2Q6ZU65 1347 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB43O43298 467 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 RXRAP19793 462 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 FECHP22830 423 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 MICU3Q86XE3 530 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA20Q8TB22 786 aa23■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 NTRK3Q16288 839 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCC12Q96J65 1359 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 PHACTR2O75167 634 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 WASF1Q92558 559 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM87BQ96K49 555 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 SEMA3EO15041 775 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 PPFIA4O75335 1185 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 CERS3Q8IU89 383 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 NBPF3Q9H094 633 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP1CC-201ENST00000335007 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms