RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 MTA3Q9BTC8 594 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 CNNM2Q9H8M5 875 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 MCM9Q9NXL9 1143 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 FAM198AQ9UFP1 575 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 LAMB1P07942 1786 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 TNFAIP1Q13829 316 aa6.99□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 FBXL16Q8N461 479 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 NEK1Q96PY6 1258 aa6.99□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 NCOA7Q8NI08 942 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 KRT23Q9C075 422 aa6.99□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.99□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 CNTNAP1P78357 1384 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 SHTN1A0MZ66 631 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 HLA-DOAP06340 250 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 GABPAQ06546 454 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 PDE4BQ07343 736 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 RUFY3Q7L099 469 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 SNX21Q969T3 373 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 TBC1D12O60347 775 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 EGFRP00533 1210 aa6.98□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 EPS15P42566 896 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 MCM2P49736 904 aa6.98□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 PLCD1P51178 756 aa6.97□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 HAND2P61296 217 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 PICALMQ13492 652 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.97□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 CYP2D6P10635 497 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 EPHX2P34913 555 aa6.97□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 MYH1P12882 1939 aa6.96□□□□□ -1.29
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PDE4D-202ENST00000317118 CACNB3P54284 484 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.96□□□□□ -1.29
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