RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 MYL10Q9BUA6 226 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 ESPNB1AK53 854 aa21.46■■□□□ 1.03
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HCLS1-201ENST00000314583 NR1I2O75469 434 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 IL1R1P14778 569 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 NPR1P16066 1061 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 SEC23AQ15436 765 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 KRT40Q6A162 431 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
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HCLS1-201ENST00000314583 TNKSO95271 1327 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 ORC4O43929 436 aa21.46■■□□□ 1.03
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HCLS1-201ENST00000314583 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 CD209Q9NNX6 404 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-201ENST00000314583 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.46■■□□□ 1.03
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HCLS1-201ENST00000314583 A0A1W2PQ64 194 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 A0A1W2PQD8 194 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 ME1P48163 572 aa21.45■■□□□ 1.02
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HCLS1-201ENST00000314583 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.45■■□□□ 1.02
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HCLS1-201ENST00000314583 USP17L21D6R901 530 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 PDE6BP35913 854 aa21.45■■□□□ 1.02
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HCLS1-201ENST00000314583 CERS3Q8IU89 383 aa21.45■■□□□ 1.02
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HCLS1-201ENST00000314583 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
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HCLS1-201ENST00000314583 KIF28PB7ZC32 967 aa21.44■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 TYRO3Q06418 890 aa21.44■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 CAMK4Q16566 473 aa21.44■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.44■■□□□ 1.02
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HCLS1-201ENST00000314583 CALM1P0DP23 149 aa21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 CALM2P0DP24 149 aa21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 CALM3P0DP25 149 aa21.43■■□□□ 1.02
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HCLS1-201ENST00000314583 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 SPTLC2O15270 562 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 BAG3O95817 575 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 FSIP1Q8NA03 581 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.42■■□□□ 1.02
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HCLS1-201ENST00000314583 CLIC4Q9Y696 253 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 KINO60870 393 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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HCLS1-201ENST00000314583 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF11Q86T75 865 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-201ENST00000314583 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.41■■□□□ 1.02
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