RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 TNNI3KQ59H18 835 aa20.59■□□□□ 0.89
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TNNT1-201ENST00000291901 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
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TNNT1-201ENST00000291901 SIPA1L1O43166 1804 aa20.59■□□□□ 0.89
TNNT1-201ENST00000291901 ATP8B2P98198 1209 aa20.58■□□□□ 0.89
TNNT1-201ENST00000291901 SPP2Q13103 211 aa20.58■□□□□ 0.89
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TNNT1-201ENST00000291901 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.58■□□□□ 0.89
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TNNT1-201ENST00000291901 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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TNNT1-201ENST00000291901 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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TNNT1-201ENST00000291901 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 CYP7A1P22680 504 aa20.49■□□□□ 0.87
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TNNT1-201ENST00000291901 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.49■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 PEX10O60683 326 aa20.48■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 SGPL1O95470 568 aa20.48■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 IRF5Q13568 498 aa20.48■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.48■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 DEFB118Q96PH6 123 aa20.48■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.48■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 PLXNB2O15031 1838 aa20.48■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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