RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAPBQ9H115 298 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ENTPD3O75355 529 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTR9Q6PD62 1173 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM151AQ8WW52 585 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMX3Q96JJ7 454 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEK1Q96PY6 1258 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPS6KB1P23443 525 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AK2P54819 239 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNFAIP1Q13829 316 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP48Q86UV5 1035 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF3CO14782 793 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNNI2P48788 182 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLCD1P51178 756 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HAND2P61296 217 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM83AQ86UY5 434 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LDHDQ86WU2 507 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SULF1Q8IWU6 871 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 E7EWF7 191 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TEPSINQ96N21 525 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOCADQ5VW36 1801 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDIT3P35638 169 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CUL4AQ13619 759 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF213O14771 459 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD1Q15327 319 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C12orf60Q5U649 245 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CSRNP1Q96S65 589 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LAMB1P07942 1786 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM196BA6NMK8 535 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAF5O00463 557 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPARAQ07869 468 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SBK1Q52WX2 424 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INCENPQ9NQS7 918 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYH1P12882 1939 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF3Q9H094 633 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTC6Q86TZ1 520 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FZD1Q9UP38 647 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHADLQ6NUI6 762 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HLA-DOAP06340 250 aa24■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDCA5Q96FF9 252 aa24■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJC18Q9H819 358 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRKG1Q13976 671 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCOA7Q8NI08 942 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRDM1O75626 825 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GABPAQ06546 454 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q6ZUG5 572 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIPA1L1O43166 1804 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms