RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp3a25O09158 503 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abl1P00520 1123 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tpm2P58774 284 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc51Q3URS9 406 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp7b1Q60991 507 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adck5Q80V03 582 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ehd2Q8BH64 543 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NsmfQ99NF2 532 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ripk4Q9ERK0 786 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ly75Q60767 1723 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prr16A3KMN5 304 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NcapgE9PWG6 1004 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grin1P35438 938 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gse1Q3U3C9 1213 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ehmt1Q5DW34 1296 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nyap1Q6PFX7 833 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttll4Q80UG8 1193 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ints4Q8CIM8 964 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Evc2Q8K1G2 1220 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Filip1Q9CS72 1211 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vnn1Q9Z0K8 512 aa11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ampd3O08739 766 aa11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nmt2O70311 529 aa11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ano6Q6P9J9 911 aa11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Uba5Q8VE47 403 aa11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cep89Q9CZX2 791 aa11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bend4P86174 541 aa11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dydc2Q9D3X8 139 aa11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cnpy2Q9QXT0 182 aa11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3893E9Q1I1 302 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GalcP54818 684 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp4x1Q6A152 507 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MbipQ99LQ1 341 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tfcp2Q9ERA0 502 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stxbp4Q9WV89 557 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Peak1Q69Z38 1735 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cavin1O54724 392 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Irf5P56477 497 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fchsd1Q6PFY1 688 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ubac1Q8VDI7 409 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grin2dQ03391 1323 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A1Y7VML8 143 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bin1O08539 588 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptgs1P22437 602 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myo1bP46735 1107 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr119Q7TRJ5 321 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Strip1Q8C079 837 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igsf9bE9PZ19 1328 aa11.77□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tsc2Q61037 1814 aa11.77□□□□□ -0.52
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zscan20B2KFW1 1030 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dapk3O54784 448 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Usp13Q5BKP2 858 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cypt2Q6P924 180 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim11Q99PQ2 467 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zscan29E9Q5B4 869 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ftl1P29391 183 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptpn12P35831 775 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spg7Q3ULF4 781 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gas2l3Q3UWW6 683 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif22Q3V300 660 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zkscan4Q5SZT6 480 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem179Q8BHH9 233 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RadxQ8C779 850 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Col20a1Q923P0 1320 aa11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10134F6ZQC6 126 aa11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wnt7aP24383 349 aa11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpusd2Q149F1 553 aa11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aak1Q3UHJ0 959 aa11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmtc2Q56A06 836 aa11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccz1Q8C1Y8 480 aa11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rec8Q8C5S7 591 aa11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.6 ms