RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636154.2

RAB34-223, Transcript of RAB34, member RAS oncogene family, human

TSL 2 BASIC

Gene RAB34, Length 730 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB34-223	ENST00000636154	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RAB34-223	ENST00000636154	MT1G	P13640	62 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RAB34-223	ENST00000636154	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RAB34-223	ENST00000636154	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RAB34-223	ENST00000636154		K7ERS5	55 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RAB34-223	ENST00000636154		A6NED7	52 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RAB34-223	ENST00000636154	MT1L	Q93083	61 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RAB34-223	ENST00000636154	MT1M	Q8N339	61 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RAB34-223	ENST00000636154	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RAB34-223	ENST00000636154	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RAB34-223	ENST00000636154	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RAB34-223	ENST00000636154	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RAB34-223	ENST00000636154	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RAB34-223	ENST00000636154	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RAB34-223	ENST00000636154	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RAB34-223	ENST00000636154	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RAB34-223	ENST00000636154	MT4	P47944	62 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RAB34-223	ENST00000636154	ROMO1	P60602	79 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RAB34-223	ENST00000636154	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RAB34-223	ENST00000636154	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RAB34-223	ENST00000636154	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RAB34-223	ENST00000636154	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB34-223	ENST00000636154	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB34-223	ENST00000636154	MT1A	P04731	61 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB34-223	ENST00000636154	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB34-223	ENST00000636154	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB34-223	ENST00000636154	MT3	P25713	68 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RAB34-223	ENST00000636154		H3BS24	57 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RAB34-223	ENST00000636154	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RAB34-223	ENST00000636154	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RAB34-223	ENST00000636154	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RAB34-223	ENST00000636154	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAB34-223	ENST00000636154	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAB34-223	ENST00000636154	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAB34-223	ENST00000636154		A0A0A0MQY5	61 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RAB34-223	ENST00000636154	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RAB34-223	ENST00000636154	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RAB34-223	ENST00000636154	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RAB34-223	ENST00000636154	INE1	O15225	51 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RAB34-223	ENST00000636154	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RAB34-223	ENST00000636154	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RAB34-223	ENST00000636154	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RAB34-223	ENST00000636154	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RAB34-223	ENST00000636154	PRM1	P04553	51 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RAB34-223	ENST00000636154	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.24	□□□□□ -2.05
RAB34-223	ENST00000636154	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.98	□□□□□ -2.09

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