RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC61GP60059 68 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE3AQ5TA76 89 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP12-1P59990 96 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GU33 70 aa9.18□□□□□ -0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.18□□□□□ -0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 COA5Q86WW8 74 aa9.13□□□□□ -0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.12□□□□□ -0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TNP1P09430 55 aa9.1□□□□□ -0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP12-4P60329 112 aa9.04□□□□□ -0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP12-3P60328 96 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MU10 97 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 Q1T7F1 81 aa8.86□□□□□ -0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 V9GYY9 64 aa8.86□□□□□ -0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SVIPQ8NHG7 77 aa8.77□□□□□ -1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GU69 56 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PRO0628Q9UI54 55 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PSPHP1O15172 72 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR15LQ9BU68 103 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 BRK1Q8WUW1 75 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC5ACP98088 5654 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NED7 52 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-2Q701N4 177 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-8O75690 187 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1AP04731 61 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 UQCR11O14957 56 aa8.16□□□□□ -1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 OBSCNQ5VST9 7968 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.08□□□□□ -1.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PMAIP1Q13794 54 aa8.08□□□□□ -1.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.07□□□□□ -1.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ERS5 55 aa7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa7.65□□□□□ -1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.64□□□□□ -1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MT3P25713 68 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAC1Q96KF2 57 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ROMO1P60602 79 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE1EQ5T753 118 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE1CQ5T751 118 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFAF8A1L188 74 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPNS1-217ENST00000629983 LUZP6Q538Z0 58 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BS24 57 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE1FQ5T754 118 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PHGR1C9JFL3 82 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0A0MQY5 61 aa5.61□□□□□ -1.51
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-217ENST00000629983 INE1O15225 51 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC19Q7Z5P9 8384 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.45□□□□□ -1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PRM1P04553 51 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC16Q8WXI7 14507 aa3.53□□□□□ -1.84
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