RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628044.1

PFKL-212, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PFKL, Length 129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-212ENST00000628044 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PFKL-212ENST00000628044 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.07□□□□□ -1.28
PFKL-212ENST00000628044 CCDC179H3BU77 68 aa7.05□□□□□ -1.28
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.04□□□□□ -1.28
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP12-3P60328 96 aa7□□□□□ -1.29
PFKL-212ENST00000628044 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7□□□□□ -1.29
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.94□□□□□ -1.3
PFKL-212ENST00000628044 UQCR11O14957 56 aa6.93□□□□□ -1.3
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.91□□□□□ -1.3
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.82□□□□□ -1.32
PFKL-212ENST00000628044 TMEM258P61165 79 aa6.81□□□□□ -1.32
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.79□□□□□ -1.32
PFKL-212ENST00000628044 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.75□□□□□ -1.33
PFKL-212ENST00000628044 K7ERS5 55 aa6.73□□□□□ -1.33
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.68□□□□□ -1.34
PFKL-212ENST00000628044 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.65□□□□□ -1.34
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP12-4P60329 112 aa6.65□□□□□ -1.34
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.64□□□□□ -1.35
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.6□□□□□ -1.35
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.59□□□□□ -1.35
PFKL-212ENST00000628044 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.56□□□□□ -1.36
PFKL-212ENST00000628044 V9GYY9 64 aa6.53□□□□□ -1.36
PFKL-212ENST00000628044 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PFKL-212ENST00000628044 PSPHP1O15172 72 aa6.52□□□□□ -1.37
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.49□□□□□ -1.37
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.47□□□□□ -1.37
PFKL-212ENST00000628044 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.42□□□□□ -1.38
PFKL-212ENST00000628044 Q1T7F1 81 aa6.41□□□□□ -1.38
PFKL-212ENST00000628044 A6NED7 52 aa6.32□□□□□ -1.4
PFKL-212ENST00000628044 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.31□□□□□ -1.4
PFKL-212ENST00000628044 MT1AP04731 61 aa6.21□□□□□ -1.42
PFKL-212ENST00000628044 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PFKL-212ENST00000628044 ROMO1P60602 79 aa6.17□□□□□ -1.42
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.16□□□□□ -1.42
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.13□□□□□ -1.43
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.02□□□□□ -1.45
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6□□□□□ -1.45
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.96□□□□□ -1.46
PFKL-212ENST00000628044 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-8O75690 187 aa5.92□□□□□ -1.46
PFKL-212ENST00000628044 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.91□□□□□ -1.46
PFKL-212ENST00000628044 MUC5ACP98088 5654 aa5.88□□□□□ -1.47
PFKL-212ENST00000628044 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PFKL-212ENST00000628044 MT3P25713 68 aa5.72□□□□□ -1.49
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.7□□□□□ -1.5
PFKL-212ENST00000628044 PCP4P48539 62 aa5.58□□□□□ -1.52
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.53□□□□□ -1.52
PFKL-212ENST00000628044 LCE1EQ5T753 118 aa5.28□□□□□ -1.56
PFKL-212ENST00000628044 BRK1Q8WUW1 75 aa5.18□□□□□ -1.58
PFKL-212ENST00000628044 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.01□□□□□ -1.61
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.96□□□□□ -1.62
PFKL-212ENST00000628044 LCE1CQ5T751 118 aa4.89□□□□□ -1.63
PFKL-212ENST00000628044 PMAIP1Q13794 54 aa4.86□□□□□ -1.63
PFKL-212ENST00000628044 PRAC1Q96KF2 57 aa4.7□□□□□ -1.66
PFKL-212ENST00000628044 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.61□□□□□ -1.67
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.58□□□□□ -1.68
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.44□□□□□ -1.7
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
PFKL-212ENST00000628044 LCE1FQ5T754 118 aa4.37□□□□□ -1.71
PFKL-212ENST00000628044 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.3□□□□□ -1.72
PFKL-212ENST00000628044 PRO0628Q9UI54 55 aa4.24□□□□□ -1.73
PFKL-212ENST00000628044 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.14□□□□□ -1.75
PFKL-212ENST00000628044 LUZP6Q538Z0 58 aa4.11□□□□□ -1.75
PFKL-212ENST00000628044 SVIPQ8NHG7 77 aa4.08□□□□□ -1.76
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.06□□□□□ -1.76
PFKL-212ENST00000628044 PHGR1C9JFL3 82 aa4.02□□□□□ -1.77
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.76□□□□□ -1.81
PFKL-212ENST00000628044 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.68□□□□□ -1.82
PFKL-212ENST00000628044 PRM1P04553 51 aa3.13□□□□□ -1.91
PFKL-212ENST00000628044 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.06□□□□□ -1.92
PFKL-212ENST00000628044 NDUFAF8A1L188 74 aa2.96□□□□□ -1.94
PFKL-212ENST00000628044 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.49□□□□□ -2.01
PFKL-212ENST00000628044 INE1O15225 51 aa2.33□□□□□ -2.04
PFKL-212ENST00000628044 A0A0A0MQY5 61 aa2.2□□□□□ -2.06
PFKL-212ENST00000628044 H3BS24 57 aa1.77□□□□□ -2.13
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