RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 MDN1Q9NU22 5596 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 MT1GP13640 62 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 NEBP20929 6669 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRR2EP22531 72 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRR2BP35325 72 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRR2AP35326 72 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 MT1MQ8N339 61 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRR2DP22532 72 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.17□□□□□ -1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 LUZP6Q538Z0 58 aa8.13□□□□□ -1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BS24 57 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.08□□□□□ -1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.08□□□□□ -1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.05□□□□□ -1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFAF8A1L188 74 aa8.05□□□□□ -1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE3BQ5TA77 95 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MT1AP04731 61 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0A0MQY5 61 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE4AQ5TA78 99 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP12-4P60329 112 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 MT4P47944 62 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE1DQ5T752 114 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.07□□□□□ -1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 MT3P25713 68 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 INE1O15225 51 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.09□□□□□ -1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE1EQ5T753 118 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-8O75690 187 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.59□□□□□ -1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.58□□□□□ -1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE1CQ5T751 118 aa5.58□□□□□ -1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC5ACP98088 5654 aa5.56□□□□□ -1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.45□□□□□ -1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PRM1P04553 51 aa5.42□□□□□ -1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 LCE1FQ5T754 118 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.35□□□□□ -1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 PHGR1C9JFL3 82 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.73□□□□□ -1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.72□□□□□ -1.97
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