RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 SPRR2BP35325 72 aa7.53□□□□□ -1.2
CSAG3-202ENST00000617158 SPRR2AP35326 72 aa7.53□□□□□ -1.2
CSAG3-202ENST00000617158 PRAC1Q96KF2 57 aa7.53□□□□□ -1.2
CSAG3-202ENST00000617158 MT1LQ93083 61 aa7.5□□□□□ -1.21
CSAG3-202ENST00000617158 NEBP20929 6669 aa7.49□□□□□ -1.21
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.46□□□□□ -1.22
CSAG3-202ENST00000617158 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.42□□□□□ -1.22
CSAG3-202ENST00000617158 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.42□□□□□ -1.22
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.36□□□□□ -1.23
CSAG3-202ENST00000617158 MT1GP13640 62 aa7.34□□□□□ -1.23
CSAG3-202ENST00000617158 MT1MQ8N339 61 aa7.29□□□□□ -1.24
CSAG3-202ENST00000617158 SPRR2DP22532 72 aa7.26□□□□□ -1.25
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.24□□□□□ -1.25
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.18□□□□□ -1.26
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.13□□□□□ -1.27
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.12□□□□□ -1.27
CSAG3-202ENST00000617158 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.11□□□□□ -1.27
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.03□□□□□ -1.28
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.03□□□□□ -1.28
CSAG3-202ENST00000617158 LCE3BQ5TA77 95 aa7.01□□□□□ -1.29
CSAG3-202ENST00000617158 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.85□□□□□ -1.31
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.85□□□□□ -1.31
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.82□□□□□ -1.32
CSAG3-202ENST00000617158 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.8□□□□□ -1.32
CSAG3-202ENST00000617158 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.7□□□□□ -1.34
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.56□□□□□ -1.36
CSAG3-202ENST00000617158 LCE4AQ5TA78 99 aa6.45□□□□□ -1.38
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.39□□□□□ -1.39
CSAG3-202ENST00000617158 MT1AP04731 61 aa6.36□□□□□ -1.39
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.33□□□□□ -1.4
CSAG3-202ENST00000617158 MT4P47944 62 aa6.32□□□□□ -1.4
CSAG3-202ENST00000617158 LCE1DQ5T752 114 aa6.32□□□□□ -1.4
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.29□□□□□ -1.4
CSAG3-202ENST00000617158 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CSAG3-202ENST00000617158 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.16□□□□□ -1.42
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP12-4P60329 112 aa6.16□□□□□ -1.42
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.11□□□□□ -1.43
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.09□□□□□ -1.43
CSAG3-202ENST00000617158 H3BS24 57 aa6.06□□□□□ -1.44
CSAG3-202ENST00000617158 LUZP6Q538Z0 58 aa6.02□□□□□ -1.45
CSAG3-202ENST00000617158 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.98□□□□□ -1.45
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.95□□□□□ -1.46
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0A0MQY5 61 aa5.94□□□□□ -1.46
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.89□□□□□ -1.47
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.88□□□□□ -1.47
CSAG3-202ENST00000617158 MT3P25713 68 aa5.74□□□□□ -1.49
CSAG3-202ENST00000617158 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.73□□□□□ -1.49
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFAF8A1L188 74 aa5.68□□□□□ -1.5
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.59□□□□□ -1.51
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.4□□□□□ -1.54
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.39□□□□□ -1.55
CSAG3-202ENST00000617158 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.31□□□□□ -1.56
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-8O75690 187 aa5.23□□□□□ -1.57
CSAG3-202ENST00000617158 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.23□□□□□ -1.57
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.15□□□□□ -1.59
CSAG3-202ENST00000617158 LCE1EQ5T753 118 aa5.11□□□□□ -1.59
CSAG3-202ENST00000617158 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.04□□□□□ -1.6
CSAG3-202ENST00000617158 MUC5ACP98088 5654 aa4.92□□□□□ -1.62
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.85□□□□□ -1.63
CSAG3-202ENST00000617158 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.77□□□□□ -1.65
CSAG3-202ENST00000617158 LCE1CQ5T751 118 aa4.75□□□□□ -1.65
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.72□□□□□ -1.65
CSAG3-202ENST00000617158 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CSAG3-202ENST00000617158 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CSAG3-202ENST00000617158 INE1O15225 51 aa4.62□□□□□ -1.67
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.25□□□□□ -1.73
CSAG3-202ENST00000617158 PRM1P04553 51 aa4.21□□□□□ -1.74
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.18□□□□□ -1.74
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.12□□□□□ -1.75
CSAG3-202ENST00000617158 LCE1FQ5T754 118 aa3.91□□□□□ -1.78
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.73□□□□□ -1.81
CSAG3-202ENST00000617158 PHGR1C9JFL3 82 aa3.66□□□□□ -1.82
CSAG3-202ENST00000617158 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.2□□□□□ -1.9
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.52□□□□□ -2.01
CSAG3-202ENST00000617158 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.37□□□□□ -2.03
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