RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614690.1

TTC28-AS1_1.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_1, Length 162 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.98□□□□□ -1.77
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.97□□□□□ -1.77
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 A0A1B0GU69 56 aa3.93□□□□□ -1.78
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.92□□□□□ -1.78
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP12-3P60328 96 aa3.9□□□□□ -1.79
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 H7BZZ5 65 aa3.89□□□□□ -1.79
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 COX7CP15954 63 aa3.89□□□□□ -1.79
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.87□□□□□ -1.79
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP12-4P60329 112 aa3.83□□□□□ -1.8
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.77□□□□□ -1.81
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 PRR15LQ9BU68 103 aa3.74□□□□□ -1.81
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.66□□□□□ -1.82
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.66□□□□□ -1.82
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.65□□□□□ -1.83
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.64□□□□□ -1.83
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 UQCR11O14957 56 aa3.62□□□□□ -1.83
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.62□□□□□ -1.83
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 CCDC179H3BU77 68 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 MT1AP04731 61 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.52□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.51□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP5-8O75690 187 aa3.51□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 MUC5ACP98088 5654 aa3.5□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 K7ERS5 55 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.43□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.39□□□□□ -1.87
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 TMEM258P61165 79 aa3.39□□□□□ -1.87
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.37□□□□□ -1.87
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 PSPHP1O15172 72 aa3.33□□□□□ -1.88
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 Q1T7F1 81 aa3.28□□□□□ -1.88
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.27□□□□□ -1.89
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 V9GYY9 64 aa3.27□□□□□ -1.89
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.26□□□□□ -1.89
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 MT3P25713 68 aa3.25□□□□□ -1.89
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 ROMO1P60602 79 aa3.21□□□□□ -1.9
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 A6NED7 52 aa3.19□□□□□ -1.9
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LCE1EQ5T753 118 aa3.04□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 PCP4P48539 62 aa2.91□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.89□□□□□ -1.95
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.89□□□□□ -1.95
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LCE1CQ5T751 118 aa2.82□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.72□□□□□ -1.97
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.57□□□□□ -2
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LCE1FQ5T754 118 aa2.55□□□□□ -2
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 BRK1Q8WUW1 75 aa2.54□□□□□ -2
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.53□□□□□ -2
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 PMAIP1Q13794 54 aa2.42□□□□□ -2.02
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 PHGR1C9JFL3 82 aa2.41□□□□□ -2.02
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.34□□□□□ -2.03
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.34□□□□□ -2.03
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 PRO0628Q9UI54 55 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 PRAC1Q96KF2 57 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.18□□□□□ -2.06
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.18□□□□□ -2.06
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.17□□□□□ -2.06
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 SVIPQ8NHG7 77 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 LUZP6Q538Z0 58 aa1.97□□□□□ -2.09
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.83□□□□□ -2.12
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 PRM1P04553 51 aa1.63□□□□□ -2.15
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 NDUFAF8A1L188 74 aa1.58□□□□□ -2.16
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.52□□□□□ -2.17
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 INE1O15225 51 aa1.34□□□□□ -2.19
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 A0A0A0MQY5 61 aa1.32□□□□□ -2.2
TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 H3BS24 57 aa0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 361.8 ms