RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 PRR15LQ9BU68 103 aa6.01□□□□□ -1.45
STX4-217ENST00000613541 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.99□□□□□ -1.45
STX4-217ENST00000613541 PCP4P48539 62 aa5.95□□□□□ -1.46
STX4-217ENST00000613541 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.93□□□□□ -1.46
STX4-217ENST00000613541 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.91□□□□□ -1.46
STX4-217ENST00000613541 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.89□□□□□ -1.47
STX4-217ENST00000613541 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.89□□□□□ -1.47
STX4-217ENST00000613541 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.87□□□□□ -1.47
STX4-217ENST00000613541 V9GYY9 64 aa5.87□□□□□ -1.47
STX4-217ENST00000613541 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.85□□□□□ -1.47
STX4-217ENST00000613541 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.81□□□□□ -1.48
STX4-217ENST00000613541 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.8□□□□□ -1.48
STX4-217ENST00000613541 UQCR11O14957 56 aa5.78□□□□□ -1.48
STX4-217ENST00000613541 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
STX4-217ENST00000613541 Q1T7F1 81 aa5.76□□□□□ -1.49
STX4-217ENST00000613541 KRTAP12-1P59990 96 aa5.74□□□□□ -1.49
STX4-217ENST00000613541 LCE3AQ5TA76 89 aa5.73□□□□□ -1.49
STX4-217ENST00000613541 KRTAP12-4P60329 112 aa5.72□□□□□ -1.49
STX4-217ENST00000613541 TNP1P09430 55 aa5.71□□□□□ -1.5
STX4-217ENST00000613541 A8MU10 97 aa5.7□□□□□ -1.5
STX4-217ENST00000613541 PSPHP1O15172 72 aa5.68□□□□□ -1.5
STX4-217ENST00000613541 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.65□□□□□ -1.5
STX4-217ENST00000613541 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.63□□□□□ -1.51
STX4-217ENST00000613541 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
STX4-217ENST00000613541 K7ERS5 55 aa5.59□□□□□ -1.51
STX4-217ENST00000613541 KRTAP12-3P60328 96 aa5.56□□□□□ -1.52
STX4-217ENST00000613541 A6NED7 52 aa5.55□□□□□ -1.52
STX4-217ENST00000613541 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
STX4-217ENST00000613541 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.45□□□□□ -1.54
STX4-217ENST00000613541 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.35□□□□□ -1.55
STX4-217ENST00000613541 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.35□□□□□ -1.55
STX4-217ENST00000613541 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
STX4-217ENST00000613541 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.29□□□□□ -1.56
STX4-217ENST00000613541 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.27□□□□□ -1.57
STX4-217ENST00000613541 MUC5ACP98088 5654 aa5.26□□□□□ -1.57
STX4-217ENST00000613541 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
STX4-217ENST00000613541 KRTAP5-8O75690 187 aa5.24□□□□□ -1.57
STX4-217ENST00000613541 ROMO1P60602 79 aa5.18□□□□□ -1.58
STX4-217ENST00000613541 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.16□□□□□ -1.58
STX4-217ENST00000613541 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.16□□□□□ -1.58
STX4-217ENST00000613541 MT1AP04731 61 aa5.14□□□□□ -1.59
STX4-217ENST00000613541 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.12□□□□□ -1.59
STX4-217ENST00000613541 BRK1Q8WUW1 75 aa5.1□□□□□ -1.59
STX4-217ENST00000613541 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.09□□□□□ -1.59
STX4-217ENST00000613541 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.06□□□□□ -1.6
STX4-217ENST00000613541 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.04□□□□□ -1.6
STX4-217ENST00000613541 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.01□□□□□ -1.61
STX4-217ENST00000613541 SVIPQ8NHG7 77 aa4.99□□□□□ -1.61
STX4-217ENST00000613541 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.99□□□□□ -1.61
STX4-217ENST00000613541 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.98□□□□□ -1.61
STX4-217ENST00000613541 PMAIP1Q13794 54 aa4.84□□□□□ -1.63
STX4-217ENST00000613541 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.84□□□□□ -1.63
STX4-217ENST00000613541 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.8□□□□□ -1.64
STX4-217ENST00000613541 MT3P25713 68 aa4.77□□□□□ -1.65
STX4-217ENST00000613541 PRO0628Q9UI54 55 aa4.72□□□□□ -1.65
STX4-217ENST00000613541 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.7□□□□□ -1.66
STX4-217ENST00000613541 LCE1EQ5T753 118 aa4.49□□□□□ -1.69
STX4-217ENST00000613541 PRAC1Q96KF2 57 aa4.48□□□□□ -1.69
STX4-217ENST00000613541 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.44□□□□□ -1.7
STX4-217ENST00000613541 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.23□□□□□ -1.73
STX4-217ENST00000613541 LCE1CQ5T751 118 aa4.16□□□□□ -1.74
STX4-217ENST00000613541 LUZP6Q538Z0 58 aa3.9□□□□□ -1.79
STX4-217ENST00000613541 LCE1FQ5T754 118 aa3.87□□□□□ -1.79
STX4-217ENST00000613541 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.83□□□□□ -1.8
STX4-217ENST00000613541 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
STX4-217ENST00000613541 PHGR1C9JFL3 82 aa3.68□□□□□ -1.82
STX4-217ENST00000613541 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.57□□□□□ -1.84
STX4-217ENST00000613541 H3BS24 57 aa3.52□□□□□ -1.85
STX4-217ENST00000613541 A0A0A0MQY5 61 aa3.44□□□□□ -1.86
STX4-217ENST00000613541 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.36□□□□□ -1.87
STX4-217ENST00000613541 NDUFAF8A1L188 74 aa3.34□□□□□ -1.87
STX4-217ENST00000613541 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.32□□□□□ -1.88
STX4-217ENST00000613541 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.13□□□□□ -1.91
STX4-217ENST00000613541 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.13□□□□□ -1.91
STX4-217ENST00000613541 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.85□□□□□ -1.95
STX4-217ENST00000613541 INE1O15225 51 aa2.81□□□□□ -1.96
STX4-217ENST00000613541 PRM1P04553 51 aa2.62□□□□□ -1.99
STX4-217ENST00000613541 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 242.8 ms